生物医学工程专业可以考执业西药师。根据《执业药师职业资格考试报考专业参考目录》内容，生物医学工程专业属于执业药师报考条件中专业所指的“相关专业”，是可以报考执业西药师考试的。

国药监人〔2019〕12号通知第五条指出“取得药学类、中药学类相关专业相应学历或学位的人员，在药学或中药学岗位工作的年限相应增加1年”，也就是生物医学工程专业报考执业西药师，比药学类、中药学类专业报考执业西药师在药学或中药学岗位工作的年限要多一年，即：

1.取得生物医学工程专业大专学历，在药学或中药学岗位工作满6年。

2.取得生物医学工程专业本科学历或学士学位，在药学或中药学岗位工作满4年。

3.取得生物医学工程专业研究生学历或硕士学位，在药学或中药学岗位工作满2年。

4.取得生物医学工程专业博士学位，在药学或中药学岗位工作满1年。